医院坚持走特色办院之路，学科发展和特色专业建设取得了突出成绩妇产科小儿内科为河南省教育厅重点学科和卫生厅重点专科，小儿外科为河南省卫生厅重点专科，新生儿脑损伤研究实验室被省卫生厅批准为重点实验室，有妇产科学。

2023年6月根据建设规划方案，复旦大学附属妇产科医院将依托郑州大学第三附属医院建设国家妇产区域医疗中心创办河南医院，项目医院依托医院东院区位于东部组团绿博片区一期工程2017年开工，计划2023年6月投用，交由项目。

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郑州大学第三附属医院暨河南省妇幼保健院是1986年经河南省人民政府命名的集医疗保健教学科研培训和指导六位一体的河南唯一一家省级妇产儿童专科医院，承担着全省6600万妇女儿童的医疗保健以及妇产儿童专业技术人员的业务。